Quando la PA può rifiutarsi di pagare l'appaltatore nonostante i lavori siano già stati ultimati??

Ciao ragazzi! La mia domanda è un po' complessa, come da titolo secondo voi quando la PA può rifiutarsi di pagare l'appaltatore nonostante siano già stati ultimati i lavori? Nel caso di specie la PA si è rifiutata di pagare perchè mancava il conto corrente per la tracciabilità e perchè la fideiussione dell'appaltatore non era quella prevista dall'art. 113, ora è stato emesso il decreto ingiuntivo e noi dovremmo opporci... come comportarsi secondo voi?? O meglio quali sono i riferimenti normativi.. perchè io cerco cerco ma non trovo nulla o meglio trovo sempre norme ma che fanno riferimento all'esclusione del concorrente, mentre qui siamo già in fase successiva alla gara. Non so se mi sono spiegata bene.